太魯閣號出軌事件造成49死的重大傷亡，交通部長林佳龍為此宣布將請辭部長一職，行政院也公告該辭呈將於20日正式生效。至於林佳龍卸任後的動向也引發外界關注，據幕僚所述，林佳龍將回台中休息一陣子，並無其他計畫。
408次太魯閣號出軌事件發生後，交通部長林佳龍便火速前往勘查，在了解現場情況後，林佳龍對於此次慘烈的事件十分痛心，且表示希望能了解事故真相，致力於搶救行動，讓悲劇不再重演。
甚至在4月4日發文寫下「我先是一個人，才是一個交通部長。」這樣沉重的話語。也在文末表示，將在搶救工作告一段落後，主動請辭交通部長以示負責。林佳龍也表示將在卸任之前，致力完成罹難、受傷家屬撫卹機制，並籌備台鐵改革工作。
林佳龍就任交通部長期間，處理過不少突發事件，如南方澳斷橋事件、華航及長榮罷工事件都可以看到他的身影。在新冠疫情的控制中，也扮演著紓困、救濟等重要角色。
幕僚透露，林佳龍已在上週末將部長室的行李打包，且預計在辭職後將暫時回到台中休息一陣子，目前並無其他計畫。